http://www.jsps.go.jp/j-grantsinaid/03_keikaku/index.htmlここにあるように科研費の枠は色々あるのだが、以下は使える 特別推進研究 は成果が期待された研究、つまりアツい 挑戦的萌芽研究 は新しい領域の挑戦的な研究、来るかもしれない来ないかもしれな…

projects0.csv [研究分野:/基礎ゲノム科学/ OR /応用ゲノム科学/ OR /システムゲノム科学/ OR /ゲノム医科学/ OR /ゲノム情報科学/ OR /ゲノム生物学/ OR /代謝生物化学/ OR /生物分子科学/ OR /ケミカルバイオロジー/ OR /生物有機化学/] [採択年度:2002〜2…

タイトルの通りで情報は拾えました。 一度研究者の情報抽出はやっていたので簡単でした。 二度目の*.csvには手こずらなかったぜ！ なぜこんなことをやったかというと、共同研究者を結びつける時に共同研究の回数で絞るためであり。 またこれで研究者ープロジ…

今日から対象データを増やして（約一万人）解析しようとして手始めに全体のネットワークを書いてみようかなー。 と思ったところ僕のノートPC（8G）ではメモリに収まらず断念。 ただたったの１万ノードでメモリが逝ってしまうのは妙な気がしたので次数分布をp…

KAKENで研究者の情報を取得するためのクエリ researchers0.csv [研究分野:/基礎ゲノム科学/ OR /応用ゲノム科学/ OR /システムゲノム科学/ OR /ゲノム医科学/ OR /ゲノム情報科学/ OR /ゲノム生物学/ OR /代謝生物化学/ OR /生物分子科学/ OR /ケミカルバイ…

ここ３回の作業ではネットワークをpythonから簡単に打てるソフト、 pydot http://code.google.com/p/pydot/ networkx http://networkx.github.com/ について勉強ついでに簡単なネットワーク図を書いていました。ちなみにpydotはマニュアルが親切でなく情報が…

KAKENから落としたファイルから情報を抽出してjson形式にダンプして使いやすくしました。 次はgraphvizに合わせたクラス設計をしたいのでgraphvizのお勉強と、時間があればコードの設計までしたいですね。 どうせ一発でいい結果なんて出るとは思わないのでパ…

これからは毎回バイトの後にログを書きたい。 研究者ネットワーク計画に関して@iNutさんと話して、ネットワークの解析によってどういう研究スタイルが成果出るのかな〜ってのが分かったらさらにおもしろいなと思った。 今日やった作業はKAKENから得られる科…

久しぶりすぎて今までと脈略のないことを書きますがご了承を。 今、（生物系）研究者ネットワークを作ろうと考えています。そのために KAKENから落とした研究者情報から必要な情報だけを抽出、改変→json形式 情報を適当に計算して研究者間の相関をグラフ化（…

今のtogotvbotに中途半端な検索機能くっつけてもおもしろくないなーと思ってしまって、 賢い検索機能を作ったところでtogotvbotのfollowerは内輪なんだよなーって現実見ちゃって、 どうせだったらお馬鹿な機能つけたほうがatractiveだし牧場でバイトしてる人…

今回は環境設定が非常に困難であったので、まとめを。 やったこと mecab-pythonとtweepyを~/localにインストール .bash_profileをいじって環境設定 crontabをいじって環境設定 大した事なさそうだけど情弱の僕はﾋｨﾋｨ言わされた。 まずインストールに関しては…

久々の更新で申し訳ありません。 今週は動かせるレベルまで持っていけました。クエリ内の名詞の完全一致のみしか考えていないですが、ちゃんと動くようです。色々テストしてバグも潰しました。あとは実際に使ってもらって不具合を潰していきたいです。来週は…

日付は変わってしまいましたが先日（11/2）の業務報告。 検索対象が小さいのでメモリ上にDBCLS ｜ ライフサイエンス統合データベースセンターから切り取ってきた「検索対象の文章」と「URL」のセットのリストを載せてクエリの出てくる回数が一番大きいURLをt…